Семен Стешин “Lo-Hi: Practical ML Drug Discovery Benchmark”

🚀 @SBERLOGABIO webinar on bioinformatics: 👨‍🔬 Семен Стешин “Lo-Hi: Practical ML Drug Discovery Benchmark” ⌚️ Четверг 19 Октября, (Moscow time) ML модели сложно сравнить по качеству между собой. Особенно сложно сравнивать молекулярные модели, в которых проверка одного предсказания может стоить несколько тысяч долларов и занимает несколько месяцев. Семен расскажет про свою новую работу с NeurIPS 2023 “Lo-Hi: Practical ML Drug Discovery Benchmark” в которой он рассматривает две задачи — Hit Identification и Lead Optimization — и сравнивает ML модели для предсказания молекулярных свойств. Он расскажет как разделять датасеты с помощью линейного программирования, чтобы избежать утечек теста, и расскажет про простую библиотеку для сплитинга. Вы узнаете: - Работает ли ML в химии или он просто заучивает трейн. - Умеет ли ML различать небольшие модификации молекул. - Какие модели лучше подходят для поиска новых молекул. Какие лучше подходят для оптимизации (это разные модели). - Почему существующие бенчмарки не позволяют выбрать модели для реальных задач. - Где граница между модификацией существующего лекарства и по-настоящему новой молекулой. Приглашаются все причастные к разработке лекарств и все фрустрированные утечками теста в биохимическом ML. Доклад ~30 минут. Тред в Твиттере: Статья: Библиотека: