Моделирование рецепторов — 1-я лекция курса «Новости компьютерного моделирования биосистем»

Рецепторы — одна из самых интересных разновидностей белков, с помощью которых не только мы сами, но и каждая наша клетка можем чего-то чувствовать и делиться сигналами. В этой лекции я поделюсь новейшими трендами в моделировании рецепторов семейства GPCR (но не только) с помощью метода молекулярной динамики. Однако это не базовый и не систематический курс, а скорее разбор нескольких современных и актуальных научных работ. Статьи, упомянутые в лекции: 1. Structural basis for modulation of a G-protein-coupled receptor by allosteric drugs () 2. Entry from the Lipid Bilayer: A Possible Pathway for Inhibition of a Peptide G Protein-Coupled Receptor by a Lipophilic Small Molecule () 3. How does a small molecule bind at a cryptic binding site? () 4. Ингибиторы Ras: в поисках Грааля таргетной терапии () Если вам необходимо введение, можно посмотреть мои выступления в @postnauka ( или на Общем семинаре @IbchRu ( Оглавление: 0:00 Предыстория — как появился этот курс 3:15 Программа курса «Новости компьютерного моделирования биосистем» (на весну 2023 г) 9:28 Введение — что такое рецепторы? Кратко о фармакологии 38:38 1. Аллостерический модулятор мускаринового рецептора M2 1:01:38 2. Диссоциация ворапаксара от рецептора PAR-1 1:09:49 3. Cryptic pockets 1:30:59 Суперкомпьютер Anton и Дэвид Шоу